空氣加濕器若不正確使用，同樣也會對人體造成一定的傷害。專家提醒使用者在使用時注意以下幾點：
1、關節炎、糖尿病患者慎用空氣加濕器。潮濕的空氣會加重關節炎、糖尿病的病情，故一般不建議該類病人使用。若該類病人確需要使用加濕器去降低一些呼吸道并發癥的發生，應與專科醫生商量溝通確定合適的濕度，以穩定原發病的病情。
2、按照說明書的指引，定期清潔加濕器。如果加濕器本身不衛生，病菌就會隨水蒸氣漂浮在空氣中，對人體的健康同樣會造成危害。
3、不能直接將自來水加入加濕器。因為自來水中含有多種礦物質，會對加濕器的蒸發器造成損害，所含的水堿也會影響其使用壽命。自來水中的氯原子和微生物有可能隨水霧吹入空氣中造成污染。如果自來水硬度較高，加濕器噴出的水霧中因含有鈣鎂離子，會產生白色粉末，污染室內空氣。
4、隨時根據天氣情況、室內外的溫度調節加濕器的濕度。據了解，不少患者都只在剛開始購買空氣加濕器的時候調整濕度，使用以后就很少再去調節。這樣會使加濕器的作用大打折扣，一旦天氣下雨，室內外濕度上升，加濕器的濕度仍不調低，無形中就增加了濕度，既使人感覺黏呼呼的不舒服，長時間也不利于人體的健康；若天氣變得過于干燥，而加濕器的濕度仍不調高，則削弱了加濕器的作用。
